無國界醫生發表題為《我們在逃亡，他們在殺戮》的報告，揭示南蘇丹的暴力持續升級，當地人正面對嚴峻處境──無差別襲擊平民和轟炸醫院等民用設施、強制徵兵、性暴力、通行受阻以及人道空間不斷收窄。報告詳細指出，2025年1月至2026年4月期間，共有12宗針對無國界醫生員工及設施的襲擊，導致約762,000人無法獲得醫療護理。
無國界醫生呼籲南蘇丹政府、蘇丹人民解放軍反對派（Sudan People Liberation Army - In Opposition；SPLA-IO）以及衝突各方，必須保護和尊重平民及民用基礎設施。平民和包括醫療設施在內的民用設施絕不能成為襲擊目標，對其直接攻擊嚴重違反國際人道法。根據國際人道法，各方均有責任尊重和保護平民，並避免使用無差別或不對等武力，包括在人口密集地區發動空襲和使用燃燒武器。
我帶着孩子一起逃離，遠遠看到村莊在燃燒。他們放火燒屋，將當時仍困在我們草屋（tukul）的祖母燒死，老人無法和我們一起逃離，那些人就殺了他們。
一名在瓊萊（Jonglei）州邱伊（Chuil）無國界醫生的設施接受治療的流離失所婦女
政府軍、反對派武裝還是其他武裝團體發動的有目標或無差別襲擊，正日益威脅群眾的性命，並削弱了他們獲得救命護理的機會。自2025年1月起，無國界醫生平均每天治療16名因暴力受傷的傷者，地區橫跨瓊萊州、上尼羅河（Upper Nile）州、中赤道（Central Equatoria）州、湖泊（Lakes）州、瓦拉普（Warrap）州以及西赤道州這六個州以及阿卜耶伊（Abyei）和皮博爾（Greater Pibor）兩大行政區。
在這些地區，平民正面臨空襲和地面襲擊、強制徵兵、綁架以及廣泛的性暴力和基於性別的暴力。人口密集的城鎮和村莊遭受襲擊，造成平民傷亡、大規模流離失所以及民用基礎設施被摧毀。
無國界醫生在南蘇丹的項目總管姆瓦蒂亞（Zakaria Mwatia）
從無國界醫生的醫療數據中，暴力帶來的影響顯而易見，2025年該國共發生138次空襲，而2024年僅有兩次。2025年，無國界醫生治療6,095名暴力傷者，均槍傷、爆炸傷以及性和基於性別的暴力有關，較2024年4,765人顯著上升。與2024年相比，單是槍傷治療就增加77%。2026年1月到4月期間，無國界醫生已為超過1,800名因暴力受傷的傷者提供治療，其中885名為性暴力倖存者，顯示平民承受的傷害正日益加劇。
上周五晚上，她在耶伊遭一群男人施暴，不知道具體有多少人，她來我們這裏尋求治療。治療後，她的祖母帶她回村子，她以為村子安全，可是下周一，她獨自外出撿柴時，再次遭到一名身份不明的武裝男子強暴。周二，她又回到我們的診所。
2026年3月，無國界醫生一名員工在中赤道州的耶伊（Yei）民政醫院談及一名病人的經歷
醫療設施同樣未能倖免。2025年1月起，無國界醫生遭12次針對其員工及醫療設施的攻擊，其中包括綁架和搶劫。2025年5月，無國界醫生在舊凡加克（Old Fangak）支援的醫院亦遭政府軍蓄意轟炸；2026年2月，無國界醫生在蘭基安（Lankien）的醫院也遭同一部隊轟炸。烏朗（Ulang）、皮耶（Pieri）以及阿科博（Akobo）等地的設施也遭身分不明的襲擊者洗劫。同時，人道空間正以令人憂慮的速度收窄。
局勢動盪、通行受限以及援助被操縱，正日益阻礙人道組織向最有需要的人群提供援助。無國界醫生觀察到一個令人擔憂的現象：通行被封鎖，以及針對平民和人道工作者發出的撤離令。
姆瓦蒂亞
人道援助正被衝突各方用作實現軍事和政治目標的工具。企圖迫使非政府組織將援助轉移或撤離至特定地區的行為，正在剝奪整個社區——尤其是瓊萊州和上尼羅河州反對派控制的地區——獲得救命援助的機會，並阻礙開展足夠的人道應對工作。平民同時面臨被迫流離失所、即時和長期的身體傷害、營養不良和患病風險增加、心理健康需求增加以及生計受損等困境。人們在長途跋涉中無法持續獲得糧水，加上惡劣的生活條件，使得他們處境更為脆弱，而人道援助不足以及基本營養物資供應中斷，令情況雪上加霜。
無國界醫生重申，平民、醫護人員和人道組織在任何時候都必須受到保護，並須確保人道援助不受阻地送達有需要的人，不論他們身在何處。
無國界醫生自1983年以來一直在南蘇丹工作，該國仍是組織在全球最大規模的行動地區之一。自2025年初以來，戰事持續在全國升溫，政府軍——南蘇丹人民國防軍（SSPDF）及其盟友（包括烏干達人民防衛軍（UPDF））——與由多個反對派團體組成的鬆散聯盟陷入激戰，該聯盟包括蘇丹人民解放軍反對派（SPLA-IO）、民族拯救陣線（NAS）、努爾族白軍（ Nuer White Army ）及其盟友民兵。這場衝突並非簡單的兩方對立，而是一場多方參與、陣營不斷變動的戰事，且深受種族、地區和政治層面分裂所影響。
