十年前，阿富汗的戰火不絕，東北部城市昆都士(Kunduz)當時正位於衝突前線。無國界醫生於當地營運的昆都士創傷中心，為遭受爆炸、槍擊的傷者提供免費緊急手術和後續醫療護理。即使市內烽煙四起，創傷中心始終維持運作，從未關閉，短短4年便治療了近7萬名急症病人。然而，一場由美軍發動的猛烈空襲摧毀了整座醫院，切斷數以萬計阿富汗人僅存的醫療命脈。
儘管無國界醫生已向美國、阿富汗多個政府部門提供醫院的GPS坐標，在2015年10月3日深夜，昆都士創傷中心仍然遭美軍轟炸，造成42人喪生，包括24名病人、14名無國界醫生員工，以及4名病人的照顧者。在無國界醫生近54年的醫療行動中，那是組織遭受最致命的一次襲擊，當時有人在病床上被燒死，有人被炸掉頭顱，亦有人在逃離火場時射殺。
組織事後發表了內部調查報告，指出醫院範圍內並無任何持武器的參戰者，也沒有任何戰鬥發生。而美軍內部的調查報告則指，事件是人為錯誤。襲擊後，無國界醫生在阿富汗東北部的醫療工作被迫全面中止。組織花逾一年時間才在該市重啟基本醫療護理，創傷護理則更久。
基於當地的醫療需要依然龐大，無國界醫生2017年決定在當地興建新的創傷中心，並於2021年8月完工啟用，院內設有急症室、深切治療部、住院與門診部、手術室及物理治療空間，並因應阿富汗持續多變的醫療需求，開展抗菌素耐藥管理計劃、燒傷護理等項目。
