無國界醫生除了緊守獨立、中立、不偏不倚的宗旨，亦一直重視組織的透明度和問責，謹慎運用由社會大眾籌募得的資金，並向社會交代工作成果及資源運用情況。
為了讓各界更了解無國界醫生的全球醫療人道救援工作、財務狀況和及年度工作重點，組織每年均會出版活動報告。無國界醫生（國際）活動報告通常於七月出版，而無國界醫生（香港）的活動報告則於八至九月出版；並提供印刷版和電子版供公眾閱覽。
除了財政概覽，無國界醫生（香港）的活動報告亦涵蓋多項內容，包括由無國界醫生（香港）主席和總幹事為過往一年工作撰寫的年度回顧、全球各地前綫項目的醫療工作數據、派出參與醫療項目的救援人員名單、組織在亞洲地區的傳訊和倡議工作，以及探討重點人道危機的專題。
以全球醫療成果數據為例，最新出版的二○二五年國際活動報告（掃瞄QR碼可閱覽）公布，去年組織的各個項目為來自多個國家的危困病人，共提供逾一千七百萬次門診診症、接收近三百萬人次入急症室診治，並醫治逾三百五十萬宗瘧疾個案。財務方面，無國界醫生（香港）去年有超過99.7%的年度經費來自包括各界企業和市民的公眾捐款，並保持把超過八成經費用於包括緊急與醫療救援項目在內的社會使命。
無國界醫生是一個獨立的國際醫療人道救援組織，致力為受武裝衝突、疫病和天災影響，以及被排拒於醫療體系以外的人群提供緊急醫療援助，包括按需要提供藥物、疫苗及其他醫療物資。
